Réveillé en plein cauchemar par un Célestrier, sorte de gros oiseau que son peuple utilise comme monture pour fendre les cieux, Link doit se hâter de se préparer. La 25e cérémonie de la Chevauchée Céleste s’apprête à débuter. Cette épreuve de vol oppose Link aux loubards de Célesbourg, la ville natale de notre héros. Sortant vainqueur de cette épreuve, Link a le privilège de recevoir un parachâle confectionné par Zelda en guise de récompense. Cet objet lui permet d'atterrir de n’importe quelle hauteur sans problèmes. Pour célébrer la victoire de son ami, Zelda l’emmène se balader dans les cieux. L’occasion pour le joueur de découvrir la mer de nuages qui s’étend à perte de vue. Au-dessus de ces nuages flottent des ilots, dont la bourgade d’où viennent nos deux héros. Nul ne sait ce qui se cache en dessous des nuages, mais Link ne va pas tarder à le découvrir. Alors qu’elle s'apprêtait à lui déclarer son flamme, Zelda est happée par une tornade qui l’aspire loin de lui. À peine remis de cette mésaventure, Link met tout en œuvre pour la retrouver.